二氧化碳培養箱一般室內的濕度都很高，這種高濕度條件下，放置在箱體內部的水盤中的純凈水，很容易造成微生物的滋生，產生污染，導致細胞培養*失敗。

    目前，控制水盤內污染的方法有如下幾種：
1、定期(至少每兩周一次)，更換水盤內的無菌蒸餾水或無菌去離子水。
2、在水盤內添加適量硫酸銅，配制方法：20g無水硫酸銅＋5ml濃硫酸＋1L滅菌純水。
3、夏季氣溫高時，水盤里加0.02％的疊氮鈉可以有效的預防真菌污染。
4、水盤內添加適量抗生素。
5、定期為培養箱(含水盤)進行一次高溫滅菌。
6、使用的水盤污染控制試劑，如市面上有些CO2培養箱廠家提供水盤污染控制的銀離子消毒盒，說明書上描述能有效殺滅600中微生物，能持續使用6個月，但此類污染控制試劑較常規方法，存在價格較昂貴缺點。采用主動加濕的方式就不存在污染問題。